Tal como em todas as ilhas atlânticas que os portugueses encontraram desabitadas, também não se conhecem espécies faunísticas indígenas das ilhas.
Entre as espécies mais comuns na província contam-se: Mamíferos: representados por macacos (cercopitherus mona), gato-de-algália (civetta), dominha, morcego e rato.
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Barracuda Gigante.
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As águas de S. Tomé são o domínio privilegiado do atum, dos golfinhos, dos espadartes, do «Blue Marlin» e também destes enormes peixes gigantes de escamas duras; corpo alongado e roliço, boca grande e pontuda; dentes caninos e afiados. Chegam a medir 3m de comprimento total e a pesar 50kg.
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| O Pardal do Norte |
O mundo das aves é visto como uma das maravilhas da natureza do país: de 55 espécies existentes aparecem 15 somente neste lugar do mundo e pertencem assim às aves mais raras do planeta. Há uma ave de São Tomé que foi avistado somente duas vezes, em 1888 e 1991!
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| Obis Olivatre |
Os que gostam da observação de pássaros também têm nestas ilhas uma óptima ocasião para o fazer.Das cerca de 60 espécies que aqui vivem 15 são endémicas e algumas são consideradas das mais raras aves da terra como a conhecida como “ave do paraíso”
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| Caranguejo de Terra |
Idênticos aos do mar, estes caranguejos são um pouco maiores e perfeitamente adaptados à vida terrestre. Só saem com a frescura da noite, abrigando-se em buracos junto dos coqueiros para escapar ao calor e ao sol.
